(SeaPRwire) –   Suatu ketika dahulu, di sebuah gua di utara Durango, Mexico, seseorang telah membuang air besar. Sebenarnya, terdapat beberapa orang, dan kejadian ini berlaku dalam jangka masa yang agak panjang—dari sekitar 725 Masihi hingga 920 Masihi. Berkat keadaan gua yang kering, apabila ahli arkeologi menggali tempat itu pada tahun 1950-an, najis tersebut berada dalam keadaan yang cukup baik. Lapuk, kering, dan penuh dengan serat, sampel tinja ini telah memberikan pandangan berharga kepada saintis tentang jenis makanan yang dimakan oleh manusia dahulu—dan apa yang hidup di dalam usus mereka.

Deposit dari gua itu kini telah banyak dianalisis, setelah dihantar ke pelbagai makmal yang berminat untuk mengkajinya. Pada tahun 2021, satu pasukan kolaborator global—atau paleofeses, seperti yang dikenali secara halus—untuk melihat sama ada mereka dapat mengenal pasti mikrob dalam mikrobiom usus individu tersebut.

Kini, dalam yang diterbitkan dalam PLoS One, kumpulan penyelidik lain meneliti semula DNA yang diambil dari 10 sampel najis tersebut. Hasil kajian mereka sebahagian besarnya mengesahkan penemuan awal: Orang yang menghasilkan najis ini adalah perumah kepada pelbagai jenis parasit.

Menjadi Perumah kepada Cacing

Biasanya, najis yang diusahakan oleh Drew Capone, penulis utama kajian ini, adalah jauh lebih segar. Seorang ahli mikrobiologi alam sekitar di Indiana University, Capone mengkaji bagaimana sanitasi mempengaruhi kesihatan. “Kerja kami melihat, ‘Bagaimana najis masuk ke dalam alam sekitar? Di mana najis dalam alam sekitar? Bagaimana infrastruktur menghalang najis daripada masuk ke alam sekitar? Dan kemudian, apakah kesan kesihatan pediatrik najis?'” katanya.

Capone dan rakan-rakannya berminat untuk menggunakan teknik pengesanan patogen dalam najis moden pada najis purba. Kaedah ini menyaring DNA dalam sampel mencari gen-gen tertentu yang merupakan tanda-tanda parasit seperti cacing kerawit, serta patogen bakteria.

Untuk mengekstrak DNA tersebut, para penyelidik perlu mendapatkan sampel daripada paleofeses dari gua tersebut. Ia lebih sukar daripada yang mereka jangkakan: “Kami perlu mengisar najis purba ini menjadi serbuk. Kami tidak boleh memecahkan kepingan-kepingan,” kata Capone. Mereka melakukan prosedur untuk mencari padanan DNA, dan memperoleh hasil yang menunjukkan beberapa patogen yang berbeza terdapat dalam najis tersebut, termasuk cacing kerawit, parasit protozoa giardia, dan pelbagai bakteria patogenik.

Kebanyakan najis didapati positif untuk pelbagai organisma. Dalam pengalaman Capone, sejumlah besar patogen sebegitu bukanlah luar biasa di tempat-tempat dengan sanitasi yang buruk, yang membuatkannya mengesyaki bahawa orang-orang yang menyimpan najis ini berabad-abad dahulu berada dalam situasi yang serupa.

Mengapa Pilihan Teknik Penting

Walau bagaimanapun, terdapat sebab mengapa kebanyakan makmal yang mengkaji DNA purba tidak lagi menggunakan prosedur ini, kata Kirsten Bos dan Alexander Hubener, kedua-duanya pakar dalam DNA purba di Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology. DNA cenderung terurai dari masa ke masa, mereput dan pecah. Teknik lama yang digunakan dalam kertas PLoS ONE , yang bermaksud sukar untuk memastikan apa yang dilihat adalah DNA purba dan bukan DNA moden yang terselit secara tidak sengaja. Makmal yang pakar dalam DNA purba mempunyai bilik bersih berteknologi tinggi untuk meminimumkan pencemaran. Mereka juga menggunakan penjujukan generasi seterusnya yang dioptimumkan untuk bahan yang rapuh itu.

Selain itu, kebanyakan makmal akan memeriksa hujung fragmen DNA, di mana kerosakan khas berlaku, untuk mengesahkan bahawa apa yang mereka lihat benar-benar lama. Dengan teknik dalam kertas PLoS ONE, “anda tidak dapat mengetahui dengan mudah sama ada pengubahsuaian kimia yang berlaku dalam DNA purba telah berlaku,” kata Bos.

Capone berhujah bahawa banyak organisma yang diuji tidak dapat hidup lama di luar usus manusia, jadi risiko mendapat positif palsu daripada DNA moden yang diambil semasa perjalanan najis mungkin agak kecil. Tambahan pula, kerja makmal DNA purba yang khusus boleh mahal, dan teknik lama ini lebih mudah diakses.

Hubener, yang merupakan sebahagian daripada pasukan di sebalik kertas kerja 2021 yang menganalisis sampel najis dari gua, mengatakan dia skeptikal terhadap padanan dengan bakteria—ini boleh menjadi sangat sukar untuk dikenal pasti dalam sampel purba dengan teknik ini. Walau bagaimanapun, memandangkan apa yang ditemui oleh pasukannya, dan memandangkan apa yang kita tahu tentang biologi parasit, dia mengatakan penemuan mengenai parasit yang lebih besar seperti cacing adalah lebih kukuh. “Bagi saya, itu boleh dipercayai,” kata Hubener.

Apa yang akan menjadi sangat menarik ialah menggunakan kedua-dua teknik lama dan baharu pada sampel yang sama, kata Bos. Itu akan menjelaskan apa yang dapat dikesan dengan pasti oleh teknik lama yang juga muncul dengan prosedur baharu yang paling ketat.

“Itu akan menjadi cara yang sangat baik untuk bergerak ke hadapan,” katanya.